农作物论文_陆地棉CAMTA基因家族的综合分析-生物信息学

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农作物论文_陆地棉CAMTA基因家族的综合分析

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文章摘要:植物钙调蛋白结合转录激活因子（CAMTA）在激素信号转导、发育调节和环境胁迫耐受性中起着重要作用。为全面了解陆地棉CAMTA基因家族的结构特征，本研究利用生物信息学方法比对陆地棉基因组数据库，分析了GhCAMTA基因家族成员的理化性质、基因结构、保守结构域和系统发育关系以及在不同植物组织中和不同非生物胁迫下的表达特异性。结果表明：陆地棉全基因组鉴定出15个GhCAMTA基因家族成员，它们均包含CG-1 DNA结合结构域及IQ基序。系统发育分析将GhCAMTAs划分为4个亚家族，同一个系统进化树分支中的亚家族成员具有高度相似的基因结构。15个GhCAMTA基因具有不同的组织表达模式，陆地棉胚珠发育过程及不同逆境助迫下，GhCAMTA基因家族成员呈现了不同的表达模式，且基因的表达受胚珠发育时间及胁迫时间长短的影响。本研究系统分析了陆地棉中GhCAMTAs基因的一般特性，为陆地棉及其他植物中CAMTA基因的功能特性研究提供了理论基础。

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项目基金:《生物信息学》网址: http://www.swxxx.cn/qikandaodu/2022/0127/686.html