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中药学论文_金银花对肺癌基因表达生物信息学和

来源:生物信息学 【在线投稿】 栏目:期刊导读 时间:2022-01-29
作者:网站采编
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摘要:文章摘要:通过生物信息学、网络药理学和分子对接研究金银花治疗肺癌的物质基础和作用机制。从GEO数据库获得肺癌数据芯片GSE118370,GEO2R工具筛选出肺癌表达差异显著基因;TCMSP筛选

文章摘要:通过生物信息学、网络药理学和分子对接研究金银花治疗肺癌的物质基础和作用机制。从GEO数据库获得肺癌数据芯片GSE118370,GEO2R工具筛选出肺癌表达差异显著基因;TCMSP筛选金银花活性成分及作用靶点;Gene数据库得到肺癌人类基因;将数据库基因进行交集得到51个共有基因,对应金银花有效成分11个。利用String数据库构建PPI 网络和成分-靶点网络。通过DAVID和KOBAS数据库中对靶点进行GO生物富集和KEGG 通路分析,得到与癌症相关信号传导、免疫调节及其他疾病通路等。采用GEPIA数据库对20个靶点进行生存分析,筛选到5个不同表达在肺癌生存率中显著差异基因,用Proteinatlas数据库对其在肺癌组织中蛋白质表达进行免疫组化分析,并对这些基因和对应成分进行分子对接,结果显示CCNB1、ICAM1、MMP9和对应成分槲皮素、木犀草素、山奈酚均能很好结合。

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论文DOI:10.16112/j.cnki.53-1223/n.2022.01.253

论文分类号:R285

文章来源:《生物信息学》 网址: http://www.swxxx.cn/qikandaodu/2022/0129/691.html



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