农作物论文_大豆DELLA基因家族鉴定及分析-生物信息学

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农作物论文_大豆DELLA基因家族鉴定及分析

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文章摘要:DELLA基因家族是调控植物与环境互作和植物发育的重要调控因子，可以促进微生物与植物共生关系建立过程中侵染线的形成。同时是参与赤霉素信号通路的负调控蛋白，在影响植物激素相关基因表达，调节植物与微生物共生固氮和生长发育方面具有重要的作用。但是在大豆中DELLA基因家族的机构特征还没有详细分析，本研究对大豆中DELLA基因家族的基因结构、定位信息、蛋白结构、保守基序分析、系统进化树、顺势作用元件、与拟南芥同源基因的共线性关系和基因表达模式进行了研究。结果发现，大豆基因组中共有7个DELLA基因家族成员，分布在7条不同的染色体上，这些基因都只有一个外显子，一个N端DELLA结构域，并且基序分布相似，证明其基因编码序列结构域高度保守。系统进化树分析表明DELLA家族有三个亚族，其启动子区域含有大量的顺式作用元件，这些元件参与植物激素反应、干旱诱导和光反应。大豆DELLA基因Glyma.11G216500、Glyma.18G040000、Glyma.08G095800和Glyma.05G140400与拟南芥中的AT1G14920、AT1G66350和AT2G01570呈共线性关系；其中Glyma.18G040000和Glyma.11G216500在大豆各个组织中都有表达，而且表达量相对较高。以上研究丰富了我们对大豆DELLA基因家族的理解，为后续大豆DELLA基因的功能研究奠定了基础。

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论文DOI:10.19802/j.issn.1007-9084.2021224

论文分类号:S565.1

文章来源：《生物信息学》网址: http://www.swxxx.cn/qikandaodu/2022/0122/676.html